本發明公開了一種藥瓶自動輸送噴碼裝置，包括：定位座，其上設置有輸送板和橫板，所述橫板上設置有伸縮氣缸，所述定位座的頂部設置有定位板；定位桿，其一端連接有彈簧，另一端開設有桿頭；輸送盤，其圓周邊緣處開設有若干料槽，所述料槽內開設有氣孔，沿所述輸送盤轉動的圓周軌跡上依次設置有入料處、噴碼處和出料處，所述噴碼處的正上方設置有噴碼噴頭，所述出料處的正下方設置有氣槍。本發明提供的藥瓶自動輸送噴碼裝置，待噴碼的藥瓶由輸送板經伸縮氣缸自動輸送至輸送盤的入料處，并由定位桿防護定位，通過感應器感應感應塊以同時實現對料槽內的藥瓶進行智能定位和噴碼，并通過氣槍對出料處的已噴碼藥瓶實現智能出料。