本發明提供了一種基于現場可編程門陣列的接口擴展方法及系統，現場可編程門陣列(即FPGA)通過第一類接口與中央處理器(即CPU)相連，通過第二類接口與目標終端相連，所述第二類接口有若干個，不同的目標終端對應不同的第二類接口，還包括：通過所述第一類接口接收所述CPU發送的數據，得到第一數據信息；對所述第一數據信息進行解析，得到所述CPU發給所述第一數據信息對應的所述目標終端的第一原始數據；通過所述第二類接口將所述第一原始數據發給所述第一數據信息對應的所述目標終端。本發明通過FPGA實現接口擴展，使得單CPU通過一種數據接口可以控制支持多個不同接口協議的模塊，降低了成本，軟件調整更靈活。