本發明公布了二級同步甲烷發酵系統產生甲烷的方法，其步驟在于：一級發酵系統內發酵產生沼氣并積聚于進出料筒的側壁與相鄰的擋氣板或者相鄰的擋氣板之間形成的發酵區內，擠壓一級發酵管道內的沼液流向第一導水管和第二導水管，最終流入二級發酵管道內；二級發酵系統內發酵產生沼氣并積聚于二級進/出料管側壁與相鄰的擋氣板之間或者相鄰的擋氣板之間形成的發酵區內，并通過二級出料管單向流入水壓間內，待水壓間內沼液液面達到布菌裝置的排水管上部最低位置時，二級發酵管道內的沼液再通過布菌裝置的排水管流入水壓間內。